一九二八年台北帝國大學設立時,大學便從日本內地購入台灣研究先驅者伊能嘉矩的藏書、手稿及台灣原住民器物標本;其中的器物部份成為土俗學人種學研究室收藏的標本;圖書及手稿則入藏圖書館,被稱為伊能文庫。但是圖書館對於這些圖書並未進行集中管理,而是將之分散到各不同的書架上,不少手稿也未曾編目整理地被放置於書庫中。因此,伊能文庫雖然非常有名,卻無人能窺其全貌。 最近,經過長期的努力整理,已經大致可以掌握伊能文庫的內容。根據整理的結果,伊能文庫總共有約四百種資料,其中大約三百種是明治大正時代的臺灣關係洋裝書,另有約二十種台灣關係的清代刊本線裝書,和六十種抄本及手稿,伊能文庫中最珍貴的是抄本及手稿。抄本保存了不少宇內已不存的史料,伊能嘉矩的諸多手稿更是無價。
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